Trong chương tiếp theo này của Maze Runner, Thomas (Dylan O'Brien) và những người Gladers của mình phải đối mặt với thách thức lớn nhất của họ được nêu ra: tìm kiếm manh mối về các tổ chức bí ẩn và mạnh mẽ được gọi là WICKED. Chuyến đi của họ đưa họ tới cháy sém, một phong cảnh hoang vắng đầy với những trở ngại không thể tưởng tượng. Phối hợp với kháng chiến, người Gladers được đưa vào lực lượng lớn hơn hẳn WICKED và phát hiện ra kế hoạch gây sốc của chúng.